A FeSBE tem por missão:
a) integrar esforços e prover uma representação comum junto ao Governo e a Comunidade Científica, em particular a Sociedade Brasileira para o Progresso da Ciência em prol do desenvolvimento científico brasileiro;
b) patrocinar eventos científicos conjuntos com pessoas jurídicas de caráter científicos;
c) colaborar administrativamente nos eventos científicos particulares das pessoas jurídicas de caráter científicos;
d) difundir conhecimentos científicos e informações sobre política científica.